На мой взгляд, д800 это чуть более нишевый продукт, чем универсальный 5дм3. Ибо разрешение не всегда такое нужно. К тому же скорость съемки пониже (после 7д с 8 кадрами даже 6 кадров 5дм3 будут помедленне, а 4 у д800 могут заставить загрустить, если любили серии), автофокус чуток попроще. Ну и 24-70 2.8 от никон опережает по резкости 24-70 2.8л, но уступает второй версии. Правда, у никон уже есть 24-70 2.8вр, который и резок весьма, и стаб имеет довольно полезный, но цена другая. И б/у пока не найти.
С другой стороны разница между ценой комплектов будет заметная. д800 можно найти до 100, а 24-70 2.8г за 70 найти не проблема. Так что в целом тысяч 30-50 можно сэкономить. По рабочим исо точно не потеряете, по удобству управления тоже - пользуюсь обеими системами, и там и там есть плюсы и минусы, но чтоб одна была однозначно лучше сказать не могу. Еще по скинтонам может быть вопрос, если Вы критично относитесь к цветам. Ибо к 5дм3 по этому поводу вопросов нет, а д800 в целом может и приврать скинтон, надо будет научиться конвертировать (правда когда научитесь времени лишнего тратить опять же не придется).
В плюс никону можно поставить детализацию, ибо 36 мпкс все же лучше 24. Но насколько Вам нужна возможность кадрировать или печатать огромные плакаты - это тоже вопрос.
В общем и в целом, если разница в цене критична, то берите д800 (лучше, конечно, д800е или д810), если разница не особо усугубит финансовое положение, то лучше 5дм3.