Такой вопрос Вы задали, что на него так сразу и не ответишь... Вот Вы говорите "две недели". Я пока научился получать полностью устраивающий меня результат, прошло примерно 6-8 месяцев с покупки сканера (Acer 2720).
Для начала - попробуйте использовать другой софт, например vuescan - http://www.hamrick.com/
Он обращается со сканрированным изображением более бережно, чем родной драйвер. Скачайте его, запустите, отсканируйте в режиме "negative", выберите используемый тип пленки. Вот когда снова возникнут вопросы, обращайтесь.