Какие программы (plugin) для совмещения изображений?

С помощью каких программ в автоматическом режиме - можно совместить две картинки со сдвинутым изображением? То есть на входе мы имеем 2 картинки - на выхое две картинки. Но вторая картинка совмещена по отношению к первой.

не понял, что значит совместить в данном случае ?

Куча панорманых программ, включая Фотошоповский Фотомерж может сохранить совмещенные картинки как слои - делайте потом с ними что угодно, хоть сохраняйте в отдельные файлы.

Совмещение подразумевает не совмещение по краям - как в понараме, а совмещение по всему полю.
То есть снимаем 1 кадр -2 или 3 раза.
Конечная цель получить 2 или 3 идентичных по совмещению предметов (пискселей) фотки.

Что за Фотомерж?

File->Automate->Photomerge

панорамы делаю совмещение не по краям, а по пересечению
снимите с пересечением 90% - получите выше пересечение
при этом, если хотите абсолютного качества - назначайте контрольные точки лапками
а в фотошоповский файл со слоями (совмещенными) сохранять могут почти все, как я уже писал

лучше возьмите любую программу и попробуйте, чем спрашивать