Музейное объединение Ненецкого автономного округа создано 26 марта 2020 года и включает Ненецкий краеведческий музей и музей‑заповедник «Пустозерск» (филиал).
История краеведения в регионе началась в 1929 году с создания Окружного бюро краеведения (И. Выучейский, Н. Плетцов, Г. Вербов). Первая выставка прошла в 1933 году в Доме Ненца (свыше 5 тысяч посетителей). В 1934‑м основан Ненецкий краеведческий музей: он получил помещение в 60 кв. м, фонды насчитывали 316 единиц хранения. В военные годы музей вёл просветительскую работу — например, в июне 1941‑го открылась выставка «Дадим отпор немецко‑фашистским захватчикам», ежегодная посещаемость достигала 3 тысяч человек.
В 1950‑е в экспозиции появился раздел этнографии, в 1955‑м музей переехал в здание культпросветшколы, а в 1969‑м — на ул. Тыко Вылко (6 залов). В 1972‑м сотрудники впервые участвовали в археологической экспедиции у «Городища Пустозерск». С 1980‑х расширилась выставочная деятельность, музей стал культурным центром края, а в 90‑е приобрёл всероссийский и международный авторитет. Тогда же начался выпуск краеведческой литературы. В 1996 году музей временно разместился в универмаге, собственное здание (ул. Победы, 5) получил в 2009‑м.
Сейчас фонды музея насчитывают более 41 тысячи предметов: этнографические коллекции, художественные собрания, фото‑ и документы XIX–XX веков, палеонтологические и археологические материалы. Научная библиотека содержит свыше 7 600 томов. Реализуются образовательные программы («Школа юного краеведа», «Рисуем в музее») и праздники («День птиц», «День моржа»).
Музей‑заповедник «Пустозерск» открыт в 1991 году (включает «Городище Пустозерск» и мемориальную часть деревни Устье). В 1993‑м получил здание — «Дом Шевелёвых». С 2005‑го работает экспозиция «Северный дом: его облик и душа». В 2011‑м учреждение стало ГБУК. Сотрудники организуют выставки, экскурсии, Аввакумовские чтения, археологические экспедиции, эколого‑краеведческий лагерь, Школу юного исследователя (с 2012‑го) и клуб «Знатоки Арктики» (с 2015‑го).
